19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1843 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1038    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  38.84 
 
 
469 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  39.89 
 
 
450 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  29.68 
 
 
499 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  30.69 
 
 
490 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  34.01 
 
 
478 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  32.08 
 
 
500 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  33.33 
 
 
488 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  30.97 
 
 
542 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  31.58 
 
 
534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  34.07 
 
 
571 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  30.05 
 
 
587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  32.87 
 
 
488 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  28.74 
 
 
528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0757  hypothetical protein  25.56 
 
 
482 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  35.78 
 
 
526 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.32 
 
 
1059 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  34.78 
 
 
527 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2406  hypothetical protein  38.46 
 
 
499 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000716522  decreased coverage  0.000132529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>