16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0757 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  996    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  30.25 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  25.59 
 
 		 469 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  24.82 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  25.22 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  26.34 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  24.85 
 
 		 534 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  26 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  25.37 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  25 
 
 		 571 aa  77  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  26.24 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  23.25 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  23.53 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  22.85 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  21.15 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  23.01 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>