19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2048 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1052    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  33.67 
 
 
546 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  32.4 
 
 
469 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  28.93 
 
 
499 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  33.7 
 
 
450 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  34.06 
 
 
488 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  31.7 
 
 
488 aa  123  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  29.63 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0757  hypothetical protein  24.59 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  31.45 
 
 
542 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  30.19 
 
 
500 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  31.58 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  25.76 
 
 
534 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  26.43 
 
 
587 aa  87  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.78 
 
 
1059 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2406  hypothetical protein  32.18 
 
 
499 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000716522  decreased coverage  0.000132529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  28 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  33.13 
 
 
526 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  33.33 
 
 
527 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>