18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1276 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  912    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  32.86 
 
 
546 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  34.44 
 
 
571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  29.96 
 
 
469 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  26.96 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  29.01 
 
 
490 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  30.02 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0757  hypothetical protein  23.28 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  27.74 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  30.21 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  26.89 
 
 
542 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  26.49 
 
 
500 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  24.69 
 
 
534 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  31.09 
 
 
527 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  33.33 
 
 
526 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  26.98 
 
 
528 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.09 
 
 
1059 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  26.18 
 
 
587 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>