19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3511 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1071    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  35.65 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  34.64 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  32 
 
 		 587 aa  166  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  29.44 
 
 		 546 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  30.82 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  29.3 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  30.89 
 
 		 450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  29.19 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  29.16 
 
 		 542 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0757  hypothetical protein  24.85 
 
 		 482 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  27.93 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  27.49 
 
 		 490 aa  93.6  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  29.15 
 
 		 571 aa  85.1  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  29.46 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.69 
 
 		 1059 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  27.4 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  28.21 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2406  hypothetical protein  37.89 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000716522  decreased coverage  0.000132529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>