17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2406 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2406  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  927    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000716522  decreased coverage  0.000132529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  30.41 
 
 		 488 aa  86.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  35.14 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  30.1 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  35.97 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  38.91 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  31.55 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  32.78 
 
 		 490 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  34.54 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  35.9 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  37.97 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  32.45 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  35 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  38.76 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  34.56 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.52 
 
 		 1059 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  38.85 
 
 		 527 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>