18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1792 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  89.75 
 
 		 526 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1007    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  31.41 
 
 		 499 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  34.4 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  39.22 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  32.1 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  35.61 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  29.18 
 
 		 542 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  31.03 
 
 		 587 aa  84  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  32.58 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  37.82 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  35.93 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  29.69 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  30.55 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.35 
 
 		 1059 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  33.78 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  31.42 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2406  hypothetical protein  39.67 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000716522  decreased coverage  0.000132529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>