19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2174 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  851    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  56.8 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  40.26 
 
 
546 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  34.09 
 
 
499 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  35.35 
 
 
500 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  32.77 
 
 
542 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  37.22 
 
 
478 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  37.16 
 
 
488 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  31.16 
 
 
490 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  37.3 
 
 
587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  34.08 
 
 
571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  30.28 
 
 
534 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.55 
 
 
1059 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  32.92 
 
 
528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0757  hypothetical protein  25.53 
 
 
482 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  31.24 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  38.4 
 
 
526 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  33.18 
 
 
527 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2406  hypothetical protein  37.98 
 
 
499 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000716522  decreased coverage  0.000132529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>