106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0835 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0835  amidohydrolase  100 
 
 		 628 aa  1194    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5687  adenine deaminase  49.82 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  35.35 
 
 		 581 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  33.77 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  28.66 
 
 		 588 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  30.49 
 
 		 601 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  46.81 
 
 		 570 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  34.52 
 
 		 573 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  30.32 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  33.87 
 
 		 581 aa  107  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  27.48 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  34.5 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  29.68 
 
 		 571 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  29.81 
 
 		 571 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  29.11 
 
 		 571 aa  101  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  33 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  23.76 
 
 		 571 aa  95.9  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  32.69 
 
 		 565 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  28.43 
 
 		 318 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  31.41 
 
 		 613 aa  91.3  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  27.03 
 
 		 593 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  28.67 
 
 		 567 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  31.41 
 
 		 581 aa  89.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  30.45 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  25.62 
 
 		 598 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  31.33 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  30.36 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  26.28 
 
 		 570 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  37.59 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  31.65 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  29.02 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  31.77 
 
 		 597 aa  83.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  41.61 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  26.09 
 
 		 584 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  30.53 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  44.44 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  21.77 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  36.84 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  37.6 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  30.9 
 
 		 576 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  28.95 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  25.33 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  29.04 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  29.35 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  28.25 
 
 		 576 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  35.33 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  28 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  27.85 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  37.4 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  21.58 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  37.4 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  37.21 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  30.79 
 
 		 582 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  28.14 
 
 		 572 aa  71.6  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  27.06 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  30.47 
 
 		 566 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  27.51 
 
 		 573 aa  70.1  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  37.5 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  28.29 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  25.49 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  34.96 
 
 		 601 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  25.74 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  29.9 
 
 		 608 aa  66.6  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  32.85 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  32.64 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  34.68 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  22.76 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  31.88 
 
 		 600 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  27.9 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  32.61 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  39.51 
 
 		 518 aa  62  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  29.71 
 
 		 599 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  25.34 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  29.81 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  25.42 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  29.13 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  36.46 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  31.4 
 
 		 558 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  29.13 
 
 		 588 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  29.13 
 
 		 588 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  29.13 
 
 		 588 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  32.73 
 
 		 588 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  29.13 
 
 		 588 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  32.73 
 
 		 569 aa  54.3  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  32.73 
 
 		 588 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  32.73 
 
 		 588 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  32.32 
 
 		 585 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2219  putative AdeC3 adenine deaminase  33.59 
 
 		 257 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299689  hitchhiker  0.00659238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  32.73 
 
 		 588 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  25.56 
 
 		 596 aa  50.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  35.38 
 
 		 542 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  37.68 
 
 		 584 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  41.07 
 
 		 580 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  37.68 
 
 		 584 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  37.68 
 
 		 584 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  37.68 
 
 		 584 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  39.13 
 
 		 551 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  33.33 
 
 		 589 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  31.31 
 
 		 582 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  31.54 
 
 		 567 aa  47.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>