30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1108 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1108  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  254  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.59 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.34 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.21 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.82 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.45 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.21 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.4 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.06 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.89 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.21 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.08 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.34 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.36 
 
 
168 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  48 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.95 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  43.48 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.27 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.58 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  30.4 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  47.92 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.73 
 
 
155 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>