32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0600 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0600  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  704    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.709522  hitchhiker  0.000000000136146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0682  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.29 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.41 
 
 		 1238 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  23.21 
 
 		 1914 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1714 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  27.19 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.14 
 
 		 1360 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 1261 aa  56.6  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 907 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1526 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3806  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 600 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0299153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1450 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 878 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.63 
 
 		 782 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.39 
 
 		 1291 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.26 
 
 		 1147 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.27 
 
 		 875 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1212 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.45 
 
 		 816 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 924 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 810 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  21.92 
 
 		 827 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 632 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1406 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1596 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  23.2 
 
 		 941 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0831  diguanylate cyclase  23.83 
 
 		 627 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  20.27 
 
 		 1190 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  24.62 
 
 		 1158 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.27 
 
 		 1279 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.37 
 
 		 1226 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1101 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>