More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2061 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 109 aa  204  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  70.37 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  63.74 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  61.39 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  47.92 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  47.92 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  47.92 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  47.92 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  47.92 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  46.88 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  48.96 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  46 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  46 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  46 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  47.62 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  48.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  56.76 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  46.43 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  51.72 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  40.48 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  39.76 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  39.76 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  48.35 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  38.55 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  46.75 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  44.95 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.78 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.78 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  35.11 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  41.24 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.26 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  38.18 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  34.69 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  39.36 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  33.33 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  34.26 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  34.26 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  34.26 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.78 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  36.14 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  38.54 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2546  DMT superfamily multiple drug (quaternary ammonium compounds) efflux pump  35.78 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  35.56 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  35.79 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  29.47 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  37.78 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.44 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  34.44 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  39.76 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  29.47 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  35.48 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  36.46 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  39.13 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  28.42 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  28.42 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  28.42 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  28.42 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  32.63 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  34.26 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  35.56 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  35.56 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  35.56 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  32.63 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  35.56 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  29.25 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  32.22 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  31.91 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>