More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  92.31 
 
 		 109 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  65.14 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  65.14 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  65.14 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  63.3 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  63.3 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  63.3 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  63.3 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  63.3 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  61.47 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  62.39 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  62.39 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  58.33 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  59.21 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  51.65 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  48.96 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  43.69 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  42.72 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  39.6 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  38.61 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  38.61 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  38.61 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  45.05 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  37.62 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  37.62 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  43.48 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  45.07 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  37 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  37 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  43.66 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  45.07 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  37 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  37 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  38.67 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  39 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.76 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1110  small multidrug resistance protein  36.67 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  35.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  34.69 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  34.69 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  34.69 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.69 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  37.23 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  32.38 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  38 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  31.43 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  32.38 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  31.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0552  multidrug ABC transporter  38.75 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  33 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  31.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3717  small multidrug resistance protein  28.72 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2204  small multidrug resistance protein  38.75 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  40.82 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  36.96 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  30.19 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  36.96 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  29.25 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  31.63 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  28.83 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  30.69 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>