223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1813 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 112 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  64.55 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  69.23 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  60.44 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  48.42 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  48.42 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  43.33 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  44.21 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  45.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  45.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  45.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  45.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  45.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  42.68 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  42.68 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  40.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  43.75 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  53.33 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  33.93 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  41.24 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  50.67 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  40 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  40 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37.78 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  41.76 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  38.95 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  34.04 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  34.74 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.74 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  33.68 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.78 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  32.22 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.58 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  31.58 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  31.58 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  31.58 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  33.68 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  31.58 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  31.19 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  31.11 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.99 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  35.56 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  31 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  38.04 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  33.93 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  34.12 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  31.11 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  38.04 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  32.63 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  31.91 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2204  small multidrug resistance protein  34.21 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  35.11 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0552  multidrug ABC transporter  34.21 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  31.65 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  30.63 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  31.58 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  34.07 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  26.32 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  34.07 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>