163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1079 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  100 
 
 		 104 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  79.21 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  79.21 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  78.22 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  46.91 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  46.91 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  39.33 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  35.11 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  35.11 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  35.11 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  35.11 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  36.26 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  35.11 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  35.96 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  35.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  38.67 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  26.8 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  48.33 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  37.33 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  33.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  33.71 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  31.18 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  29.21 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  30.11 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  32.97 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  29.21 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  29.21 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  30.69 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  29.21 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  28.89 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  29.21 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  29.21 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  29.7 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  34.85 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  29.21 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  29.21 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  28.09 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  34.83 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  27.47 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  30.11 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  26.6 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  26.6 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  27.47 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  26.6 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  30.61 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  28.72 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  26.6 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  26.6 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6794  small multidrug resistance protein  32.05 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4847  small multidrug resistance protein  32.05 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.526287  normal  0.040677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4292  small multidrug resistance protein  32.47 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  28.89 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  26.6 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  27.62 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  29.79 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  30.77 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3717  small multidrug resistance protein  25.84 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  37.1 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  37.1 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  37.1 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  26.37 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  27.27 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.46 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  27.1 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  37.1 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  28.43 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  26.44 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  35.48 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  35.48 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  29.13 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  25.77 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  31.82 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1576  small multidrug resistance protein  31.71 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>