197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2304 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  53.85 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  53.85 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  54.37 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  50.56 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  45.92 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  45.45 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  45.45 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  43.43 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  40.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  40.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  40.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  40.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  40.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  38.89 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  43.62 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  41.76 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  38.37 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  38.37 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  38.37 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  38.71 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  37.63 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  34.86 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  45.07 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  43.66 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  31.87 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  36.47 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  31.94 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  30.34 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  28.72 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  30.34 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  29.9 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  29.59 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  32.65 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.46 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  32.63 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.46 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  27.47 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  30.38 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  30.38 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  27.47 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  27.47 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  32.65 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  32 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  30.26 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  42.86 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  25.25 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  28.12 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  30.85 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  27.47 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  32.65 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  30.49 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  31.46 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  31.46 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  26.37 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  31.46 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  31.76 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2496  small multidrug resistance protein  35.62 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000466743  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  31.58 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  30.21 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  36.67 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  28.74 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  36.26 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  40.24 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  32.61 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  31.58 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  31.58 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  31.58 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  32.05 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  36.59 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  26.92 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  31.76 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0552  multidrug ABC transporter  32.05 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  28.57 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  28.24 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  38.71 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  30.59 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>