283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0064 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 110 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  64.55 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  71.43 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  66.67 
 
 		 111 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  54.17 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  54.17 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  54.17 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  54.17 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  54.17 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  53.12 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  51.02 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  51.02 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  51.02 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  52.08 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  54.08 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  52.08 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  52.08 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  45.92 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  61.33 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  58.67 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  49.45 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  39.76 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  39.76 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  37.35 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  54.84 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  35.23 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.11 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.11 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  40 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  42.71 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  40 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  41.24 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  39.8 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  36.27 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36.27 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  36.27 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  42.27 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  42.27 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  36.27 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  36.27 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  36.67 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  35.79 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  30.3 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  41.05 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.78 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  32.98 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  36.96 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  39.36 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  28.28 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  35 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0552  multidrug ABC transporter  38.96 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2204  small multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  35.37 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  34.69 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  35.37 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  36.46 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  31.63 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  38.04 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  41.94 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  38.24 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  35.42 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  40.32 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  31.96 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>