120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1361 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 108 aa  206  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  58.43 
 
 		 109 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  55.34 
 
 		 109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 112 aa  83.6  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  44.94 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  43.01 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  43.01 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  43.01 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  43.01 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  43.01 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  44 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  45.05 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  40 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  40 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  40 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  45.45 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  43.18 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  44.09 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  36.25 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  43.01 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  37.18 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  37.18 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  34.62 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  36.96 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  35.16 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  33.71 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  29.25 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  38.67 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  29.25 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  34.07 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  34.07 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.87 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.87 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  30.95 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  32.1 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  30.95 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  22.45 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  30.95 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  30.95 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  30.95 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  30.95 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  30.95 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  30.95 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  30.53 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  30.12 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  39.29 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  32.14 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  31 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  36.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  36.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  36.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  36.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  36.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  36.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  36.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  29.76 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  34.04 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  30.34 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  26.19 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  37.84 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  38.89 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  33.71 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  33.71 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.89 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  26.21 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  35.44 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  35.44 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  37.84 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  35.44 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  34.15 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  34.15 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  36.96 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  30.12 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  30.86 
 
 		 106 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  29.13 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  34.15 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  34.94 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>