215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0721 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 80 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  52.63 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  52.63 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  52.63 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  52.63 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  52.63 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  53.95 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  59.68 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  65.45 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  63.64 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  54.84 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  43.42 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  41.33 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  44.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  46.05 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  46.05 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  44.74 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  44.74 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  44.74 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  44.74 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  44.74 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  38.16 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  38.16 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  43.42 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  43.42 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  43.42 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  49.18 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.47 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  39.47 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  39.47 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  56.86 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  38.16 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  56.86 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  38.16 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  33.77 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  33.77 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  38.16 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.98 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.84 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.84 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  38.16 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  38.46 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  37.18 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  37.18 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  37.18 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  37.33 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  38.03 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.18 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  35.53 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  32.47 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  32.47 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  32.47 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  32.47 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  32.47 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  34.21 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  32.47 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  32.89 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  35.53 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  43.55 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  32.47 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  33.77 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  37.18 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  40.85 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 112 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  43.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  31.17 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  35.53 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  28.95 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  37.04 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  35.53 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  35.53 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  30.26 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  40.98 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  37.66 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>