More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1917 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1917  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
650 aa  1264    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0514  heavy metal translocating P-type ATPase  55.85 
 
 
633 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
630 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2304  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
686 aa  405  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
625 aa  395  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  37.38 
 
 
783 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0093  heavy metal translocating P-type ATPase  39.16 
 
 
619 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  36.13 
 
 
623 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21740  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
631 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000439315  normal  0.410793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1366  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
622 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  38.48 
 
 
670 aa  357  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
707 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  36.52 
 
 
639 aa  355  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
868 aa  350  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
712 aa  350  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  38.32 
 
 
689 aa  347  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1348  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
643 aa  346  6e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0452174  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.16 
 
 
639 aa  346  8e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
637 aa  345  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  34.24 
 
 
645 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
713 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
712 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
712 aa  342  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  35.01 
 
 
616 aa  340  4e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  37.26 
 
 
718 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  38.73 
 
 
639 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  38.54 
 
 
627 aa  337  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 
809 aa  337  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 
833 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
767 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
904 aa  332  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  34.09 
 
 
812 aa  331  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  37.41 
 
 
817 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
751 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  35.09 
 
 
826 aa  330  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
822 aa  329  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  35.73 
 
 
785 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  34.96 
 
 
825 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  35.46 
 
 
835 aa  326  7e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
834 aa  326  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  35.25 
 
 
758 aa  326  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
699 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
737 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.54 
 
 
628 aa  324  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
646 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  33.28 
 
 
926 aa  323  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  35.12 
 
 
735 aa  323  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
750 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  36.87 
 
 
738 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
656 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  34.97 
 
 
835 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
750 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  35.18 
 
 
851 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
798 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.52 
 
 
773 aa  321  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  38.29 
 
 
722 aa  321  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  36.24 
 
 
750 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
795 aa  320  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  34.95 
 
 
769 aa  320  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
821 aa  320  7e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 
679 aa  320  7e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
750 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.05 
 
 
709 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  37.89 
 
 
747 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1763  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
720 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.54 
 
 
667 aa  319  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  38.55 
 
 
792 aa  319  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 
643 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  34.81 
 
 
833 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34 
 
 
889 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  36.3 
 
 
734 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  36.43 
 
 
793 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 
836 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  37.17 
 
 
826 aa  317  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.43 
 
 
744 aa  317  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 
800 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  33.89 
 
 
817 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  33.89 
 
 
817 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  35.4 
 
 
748 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
651 aa  316  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  35.76 
 
 
842 aa  316  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
786 aa  316  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  33.03 
 
 
677 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
781 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.38 
 
 
797 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
781 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.81 
 
 
889 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  35.91 
 
 
742 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
820 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
794 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  33.63 
 
 
602 aa  314  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
829 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  36.98 
 
 
829 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  34.34 
 
 
634 aa  313  5.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  34.71 
 
 
823 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  34.93 
 
 
851 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  35.17 
 
 
701 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 
799 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  38.22 
 
 
748 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>