67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1970 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1970  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  243  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.680735  hitchhiker  0.00000422854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.53 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 262 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.46 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.88 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 240 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  23.64 
 
 		 261 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  28.12 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 236 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  34.85 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.09 
 
 		 319 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 236 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.95 
 
 		 247 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1495  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  24.77 
 
 		 260 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.67 
 
 		 251 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.18 
 
 		 236 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  26.04 
 
 		 232 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 249 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.05 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.38 
 
 		 242 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.59 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  26.76 
 
 		 330 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  24.47 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  24.49 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  33.33 
 
 		 238 aa  41.2  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  26.76 
 
 		 268 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  31.75 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  31.75 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.21 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.16 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 276 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  20.55 
 
 		 239 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 335 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  31.88 
 
 		 238 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 335 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 238 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 304 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 335 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  31.88 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  31.88 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  31.88 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  31.88 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  31.88 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.25 
 
 		 335 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  31.88 
 
 		 238 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  31.25 
 
 		 335 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>