130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0914 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0914  benzoate transporter  100 
 
 		 395 aa  777    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000043909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1772  benzoate transporter  39.3 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.457132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4199  Benzoate membrane transport protein  27.11 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2760  benzoate membrane transport protein:xanthine/uracil/vitamin C permease  28.35 
 
 		 415 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1757  major facilitator superfamily permease  28.53 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.991656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  28.2 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  29.79 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  28.73 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  31.17 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  28.75 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  28.96 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  27.27 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  30.31 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  29.16 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  29.16 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  29.16 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  31.23 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  29.16 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  28.24 
 
 		 422 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  27.41 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  31.32 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  31.51 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  30.99 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  30.77 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  29.78 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  28.17 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  30.37 
 
 		 398 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3584  Benzoate membrane transport protein  26.42 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.497015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  30.87 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  27.4 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  29.61 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  27.94 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  30.6 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  27.68 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  28.46 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  30.65 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  28.27 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  28.2 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  26.96 
 
 		 647 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  26.96 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  26.7 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  26.7 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  26.15 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  30.57 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  29.05 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  30.53 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  30.6 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  28.98 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  26.49 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  31.12 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  29.2 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  27.2 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  27.98 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  27.58 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  25.59 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  26.67 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  29.02 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  27.79 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  29.66 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  27.7 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  26.49 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  25.39 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  29 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  29.29 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  26.22 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  25.46 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  28.68 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  28.12 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  28.21 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  29.66 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  24.35 
 
 		 388 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  28.16 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  27.27 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  25.56 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2262  benzoate transporter  25.44 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.534042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  29.4 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  28.13 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  27.78 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  28.39 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  28.39 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  27.85 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  27.85 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  27.85 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  27.85 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  27.85 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  27.88 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  28.39 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  27.78 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  25.93 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  27.62 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  28.38 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  28.72 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  27.25 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  27.53 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  27.86 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  27.86 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  28.49 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  26.06 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0411  putative benzoate transporter protein  26.74 
 
 		 427 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0767  benzoate transporter  26.71 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>