53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0563 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  780    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  48.98 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  49.1 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  41.71 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  41 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  29.98 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  29.98 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  29.76 
 
 		 446 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  30.6 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  32.37 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  26.03 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  29.33 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  28.92 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  32.52 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  27.91 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  26.92 
 
 		 470 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  29.4 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  28.16 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  29.47 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  29.47 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  29.84 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  28.99 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  29.7 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  28.83 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  35.06 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  27.61 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  33.61 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  32.31 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  25.71 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  25.66 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  31.48 
 
 		 480 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.52 
 
 		 771 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  24.64 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  33.05 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  32.01 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  29.05 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  24.93 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  23.53 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  24.58 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  21.88 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  27.59 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  27.59 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  34.64 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  27.87 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  28.22 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  34.23 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>