43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0332 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  778    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  68.38 
 
 
389 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  60.45 
 
 
403 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  52.72 
 
 
407 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  43.85 
 
 
403 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  43.15 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  42.89 
 
 
400 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  42.89 
 
 
400 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  41.22 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  37.85 
 
 
398 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  38.11 
 
 
398 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  38.62 
 
 
404 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  33.92 
 
 
398 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  34.58 
 
 
418 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  32.82 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  32.82 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  31.23 
 
 
408 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  31.76 
 
 
412 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  31.76 
 
 
412 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  27.42 
 
 
404 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  28.6 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  27.77 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  27.36 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  31.89 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  29.6 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  30.99 
 
 
470 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  29.66 
 
 
434 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  29.36 
 
 
453 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  26.3 
 
 
446 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  30.41 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  28.5 
 
 
387 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  28.02 
 
 
471 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  31.9 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  27.98 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  30.42 
 
 
480 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  27.98 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  30.79 
 
 
392 aa  93.2  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  30.77 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  33.61 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  30.34 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.35 
 
 
771 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  26.75 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  26.76 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>