41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1159 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  96.8 
 
 
437 aa  815    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  836    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  51.87 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  52.41 
 
 
471 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  54.66 
 
 
480 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  50 
 
 
395 aa  391  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  46.15 
 
 
470 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  43.5 
 
 
435 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  46.91 
 
 
434 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  46.17 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  35.42 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  34.58 
 
 
456 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  35.34 
 
 
412 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  33.57 
 
 
412 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  33.65 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  34.83 
 
 
415 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  34.24 
 
 
404 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  33.64 
 
 
446 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  33.48 
 
 
453 aa  199  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  31.23 
 
 
398 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  30.99 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  30.81 
 
 
418 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  31.13 
 
 
401 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  31.21 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  31.21 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  29.74 
 
 
398 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  30.4 
 
 
404 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  29.47 
 
 
400 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  29.18 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  28.68 
 
 
400 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  28.5 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  27.06 
 
 
396 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  27.64 
 
 
392 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  25.74 
 
 
397 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  27.7 
 
 
407 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  29.41 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  28.84 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  29.4 
 
 
413 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  27.05 
 
 
401 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  27.98 
 
 
393 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.54 
 
 
771 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>