42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0121 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  807    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  48.92 
 
 
412 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  48.92 
 
 
412 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  51.11 
 
 
412 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  47.24 
 
 
415 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  45.24 
 
 
446 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  44.83 
 
 
456 aa  320  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  40.61 
 
 
453 aa  297  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  35.91 
 
 
404 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  40.49 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  40.1 
 
 
480 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  35.42 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  36.8 
 
 
471 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  35.04 
 
 
437 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  32.93 
 
 
470 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  38.99 
 
 
395 aa  229  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  33.17 
 
 
453 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  32.93 
 
 
434 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  31.22 
 
 
435 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  36.1 
 
 
404 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  35.95 
 
 
398 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  35.71 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  34.97 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  37.9 
 
 
401 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  32.48 
 
 
401 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  32.48 
 
 
401 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  34.2 
 
 
418 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  28.61 
 
 
400 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  28.78 
 
 
400 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  30.56 
 
 
396 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  29.33 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  31.23 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  32.54 
 
 
389 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  33.26 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  32.61 
 
 
387 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  28.54 
 
 
407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  31.7 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.45 
 
 
771 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  30.94 
 
 
392 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  33.25 
 
 
413 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  32.15 
 
 
401 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0123  hypothetical protein  96.55 
 
 
29 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>