43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1624 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  796    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  51.41 
 
 
387 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  49.1 
 
 
413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  39.7 
 
 
392 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  38.29 
 
 
401 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  28.4 
 
 
398 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  27.65 
 
 
398 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  31.7 
 
 
408 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  27.99 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  27.99 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  28.16 
 
 
398 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  31.22 
 
 
412 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  29.01 
 
 
401 aa  123  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  29.2 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  27.6 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  30.1 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  27.88 
 
 
401 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  27.88 
 
 
401 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  26.2 
 
 
404 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  29.35 
 
 
456 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  27.25 
 
 
453 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  24.7 
 
 
400 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  27.03 
 
 
415 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.39 
 
 
771 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  24.46 
 
 
400 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  24.76 
 
 
396 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  23.6 
 
 
435 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  24.22 
 
 
403 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  24.4 
 
 
470 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  26.81 
 
 
437 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  25.74 
 
 
406 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  24.11 
 
 
453 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  27.64 
 
 
407 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  27.6 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  29.51 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  27.92 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  26.88 
 
 
480 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  29.32 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  26.99 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  28.35 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  26.24 
 
 
370 aa  43.5  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>