43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2359 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  775    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  68.38 
 
 
393 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  62.56 
 
 
403 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  52.14 
 
 
407 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  42.82 
 
 
403 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  42.07 
 
 
400 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  41.56 
 
 
400 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  41.73 
 
 
396 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  39.29 
 
 
401 aa  248  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  37.22 
 
 
398 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  36.96 
 
 
398 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  37.5 
 
 
404 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  33.08 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  33.59 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  33.59 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  33.93 
 
 
418 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  32.54 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  32.54 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  33.41 
 
 
412 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  32.61 
 
 
408 aa  155  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  27.23 
 
 
404 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  28.44 
 
 
456 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  30.75 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  29.16 
 
 
446 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  30.48 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  27.21 
 
 
470 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  27.05 
 
 
434 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  26.99 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  26.76 
 
 
435 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  30.84 
 
 
402 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  31.17 
 
 
480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  28.99 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  31.75 
 
 
471 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  28.99 
 
 
406 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  31.87 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  32.65 
 
 
395 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  30.18 
 
 
392 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  28.82 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.13 
 
 
771 aa  89.7  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  32.76 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  29.79 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  26.96 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>