54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4077 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  99.25 
 
 
398 aa  814    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  821    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  52.94 
 
 
401 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  50.5 
 
 
404 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  51.41 
 
 
418 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  49.62 
 
 
401 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  49.62 
 
 
401 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  47.87 
 
 
398 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  35.47 
 
 
403 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  34.65 
 
 
400 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  33.82 
 
 
396 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  36.48 
 
 
407 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  33.83 
 
 
400 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  37.85 
 
 
393 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  36.96 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  37.28 
 
 
403 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  34.69 
 
 
412 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  35.95 
 
 
408 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  33.09 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  34.92 
 
 
415 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  33.18 
 
 
456 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  31.44 
 
 
446 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  31.15 
 
 
453 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  32.94 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  32.94 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  33.82 
 
 
387 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  30.99 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  31.23 
 
 
437 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  31.25 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  30.36 
 
 
470 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  31.09 
 
 
453 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  29.51 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  32.13 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  28.57 
 
 
395 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  27.65 
 
 
397 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  28.09 
 
 
435 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  30.13 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  30.62 
 
 
480 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  30.98 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  29.98 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.54 
 
 
771 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  22.78 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  25.83 
 
 
372 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  22.03 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  23.11 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  23.95 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  24.15 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  20.92 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  38.95 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  22.78 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  29.14 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  25.44 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  24.71 
 
 
375 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>