42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0676 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  800    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  52.94 
 
 
398 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  52.94 
 
 
398 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  47.46 
 
 
398 aa  345  8.999999999999999e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  48.36 
 
 
404 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  45.57 
 
 
401 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  45.57 
 
 
401 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  47.42 
 
 
418 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  41.22 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  33.74 
 
 
403 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  34.34 
 
 
396 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  38.39 
 
 
400 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  35.07 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  37.8 
 
 
400 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  39.29 
 
 
389 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  38.48 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  34.84 
 
 
415 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  33.65 
 
 
412 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  33.65 
 
 
412 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  37.9 
 
 
408 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  33.95 
 
 
446 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  35.85 
 
 
412 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  30.86 
 
 
404 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  33.26 
 
 
456 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  30.85 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  31.13 
 
 
406 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  31.13 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  29.91 
 
 
471 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  33.98 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  32.12 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  32.48 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  28.85 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  27.85 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  29.86 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  31.14 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  27.05 
 
 
435 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  30.87 
 
 
395 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  31.31 
 
 
480 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  29.01 
 
 
397 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.81 
 
 
771 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  32.31 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.21 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>