More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0701 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0701  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 
435 aa  842    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2514  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.35 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317709  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  33.81 
 
 
413 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  34.43 
 
 
413 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  34.05 
 
 
413 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  34.29 
 
 
413 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  33.25 
 
 
431 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  30.68 
 
 
452 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  32.09 
 
 
427 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  30.68 
 
 
452 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  32.57 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  30.88 
 
 
451 aa  200  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  33.87 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  32.64 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  34.6 
 
 
479 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  35.83 
 
 
457 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  35.24 
 
 
457 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  35.24 
 
 
457 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  32.33 
 
 
487 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  33.71 
 
 
461 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 
458 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 
458 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  32.95 
 
 
457 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 
458 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  33.18 
 
 
458 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  31.47 
 
 
460 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  32.01 
 
 
458 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  32.95 
 
 
458 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  29.29 
 
 
440 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  29.29 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  29.29 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  29.29 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  29.76 
 
 
440 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  30.21 
 
 
442 aa  190  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  29.05 
 
 
440 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  29.05 
 
 
440 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  29.05 
 
 
440 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  29.05 
 
 
440 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  29.05 
 
 
440 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  30.73 
 
 
446 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  29.05 
 
 
440 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  32.06 
 
 
448 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  32.47 
 
 
466 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  32.24 
 
 
466 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  32.36 
 
 
468 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  31.03 
 
 
495 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  33.17 
 
 
435 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  30.95 
 
 
501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  32.85 
 
 
465 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  32.1 
 
 
505 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  32.31 
 
 
438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  32.36 
 
 
482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  32.55 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  32.24 
 
 
465 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  33.88 
 
 
469 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  31.22 
 
 
463 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  30.54 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  31.91 
 
 
468 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  31.66 
 
 
450 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  31.39 
 
 
469 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  31.61 
 
 
469 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  32.96 
 
 
466 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  29.36 
 
 
496 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  30.57 
 
 
495 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  33.49 
 
 
469 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  33.64 
 
 
471 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  31.55 
 
 
505 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  30.79 
 
 
495 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  30.63 
 
 
458 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  31.59 
 
 
566 aa  176  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  30.79 
 
 
495 aa  176  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  30.86 
 
 
449 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  31.32 
 
 
505 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1309  Xanthine/uracil permease  32.77 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00197381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  31.32 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  31.3 
 
 
490 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  32.52 
 
 
463 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  30.88 
 
 
503 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  32.45 
 
 
466 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  33.78 
 
 
470 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  29.8 
 
 
442 aa  170  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  29.49 
 
 
493 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  30.88 
 
 
647 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  30.43 
 
 
446 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  29.57 
 
 
422 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  28.54 
 
 
459 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  29.84 
 
 
825 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  31.6 
 
 
506 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  33.56 
 
 
466 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  30.23 
 
 
494 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  33.94 
 
 
469 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  32.1 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  29.79 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  33.17 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  32.86 
 
 
500 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  33.72 
 
 
469 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  31.34 
 
 
633 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  30.82 
 
 
449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  33.11 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>