More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0234 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  100 
 
 
487 aa  954    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  50.69 
 
 
450 aa  415  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  44.76 
 
 
460 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1498  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.41 
 
 
427 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000560897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.03 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  38.43 
 
 
465 aa  329  8e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  35.49 
 
 
458 aa  293  7e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  34.45 
 
 
449 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  37.53 
 
 
454 aa  266  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  37.96 
 
 
466 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2967  xanthine permease  34.84 
 
 
462 aa  256  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  36.57 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  36.99 
 
 
461 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  35 
 
 
452 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  34.78 
 
 
452 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  36.4 
 
 
470 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  38.39 
 
 
445 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  33.91 
 
 
479 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  32.81 
 
 
451 aa  233  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  35.73 
 
 
474 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  37.01 
 
 
438 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  33.47 
 
 
478 aa  230  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  34.08 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  35.23 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  29.79 
 
 
486 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  34.93 
 
 
431 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  34.8 
 
 
458 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  35.36 
 
 
489 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  33.11 
 
 
482 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  33.11 
 
 
482 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  33.11 
 
 
482 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  33.11 
 
 
482 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  33.11 
 
 
482 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  33.11 
 
 
525 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  33.11 
 
 
525 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  33.19 
 
 
463 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  33.11 
 
 
482 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  35.24 
 
 
435 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  32.87 
 
 
442 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  31.37 
 
 
458 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  35.57 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  29.3 
 
 
500 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  32.89 
 
 
458 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  34 
 
 
440 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  32.12 
 
 
466 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  31.54 
 
 
472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  31.54 
 
 
461 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  34.29 
 
 
427 aa  196  9e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  31.65 
 
 
462 aa  196  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  32.88 
 
 
458 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  31.7 
 
 
488 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  31.39 
 
 
468 aa  196  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  32.87 
 
 
468 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  32.88 
 
 
458 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  31.54 
 
 
461 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  31.36 
 
 
468 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  32.67 
 
 
495 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  34.02 
 
 
440 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  34.25 
 
 
440 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  30.35 
 
 
453 aa  193  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  34.78 
 
 
440 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  34.78 
 
 
440 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  32.96 
 
 
457 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  34.17 
 
 
460 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  32.21 
 
 
458 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  32.21 
 
 
458 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  34.02 
 
 
440 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  32.81 
 
 
479 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  32.72 
 
 
501 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  31.22 
 
 
457 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  34.54 
 
 
440 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  31.87 
 
 
462 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  34.54 
 
 
440 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  34.54 
 
 
440 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  34.54 
 
 
440 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  34.54 
 
 
440 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  33.57 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  32.81 
 
 
457 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  32.81 
 
 
457 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  32.37 
 
 
446 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  35.85 
 
 
459 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  34.52 
 
 
438 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  30.39 
 
 
465 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  33.18 
 
 
465 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  31.76 
 
 
458 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  33.49 
 
 
451 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  32.57 
 
 
422 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  32.6 
 
 
482 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  32.5 
 
 
466 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  31.66 
 
 
448 aa  189  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  32.32 
 
 
462 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  33.25 
 
 
451 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  35.29 
 
 
566 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  31.18 
 
 
466 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  32.65 
 
 
469 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  29.74 
 
 
495 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  32.27 
 
 
466 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  33.02 
 
 
451 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  30.04 
 
 
464 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  31.79 
 
 
463 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>