More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0895 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  84.26 
 
 
413 aa  692    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  97.58 
 
 
413 aa  760    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  100 
 
 
413 aa  798    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  97.09 
 
 
413 aa  759    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  38.55 
 
 
451 aa  254  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0418  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.05 
 
 
464 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  34.05 
 
 
452 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  33.81 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0701  xanthine/uracil permease family protein  33.81 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  36.1 
 
 
505 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  34.93 
 
 
489 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  35.1 
 
 
438 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  34.89 
 
 
431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  34.77 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  35.1 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  35.46 
 
 
505 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  34.62 
 
 
509 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  35.22 
 
 
505 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  35.56 
 
 
503 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  34.75 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  33.25 
 
 
501 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  35.01 
 
 
461 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  34.13 
 
 
482 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  34.13 
 
 
482 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  34.13 
 
 
482 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  34.13 
 
 
482 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  34.13 
 
 
525 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  34.13 
 
 
482 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  34.13 
 
 
482 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  34.13 
 
 
525 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  33.41 
 
 
460 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  33.33 
 
 
458 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  33.33 
 
 
458 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  32.85 
 
 
466 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  33.33 
 
 
457 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.34 
 
 
459 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  33.57 
 
 
452 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  33.57 
 
 
458 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  33.09 
 
 
466 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  34.04 
 
 
496 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  33.09 
 
 
458 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  33.81 
 
 
451 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  33.09 
 
 
506 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  34.6 
 
 
493 aa  206  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  35.93 
 
 
479 aa  206  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  33.09 
 
 
465 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  33.09 
 
 
458 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  33.1 
 
 
463 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  32.79 
 
 
468 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  33.89 
 
 
455 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  33.89 
 
 
455 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  35.85 
 
 
449 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  32.85 
 
 
458 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  33.01 
 
 
446 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  32.61 
 
 
458 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  31.28 
 
 
442 aa  202  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  33.57 
 
 
451 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  32.78 
 
 
444 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  32.53 
 
 
440 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.57 
 
 
482 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  33.49 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  33.33 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  31.63 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  33.81 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  33.01 
 
 
451 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  31.87 
 
 
440 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  31.26 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  36.67 
 
 
478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  32.94 
 
 
566 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  34.74 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  30.94 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  31.03 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2967  xanthine permease  34.59 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  31.8 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  31.96 
 
 
427 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  34.45 
 
 
500 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  32.94 
 
 
452 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  31.55 
 
 
468 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  32.48 
 
 
475 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  33.25 
 
 
457 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  32.48 
 
 
475 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  31.96 
 
 
422 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  29.78 
 
 
495 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  32.54 
 
 
435 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  32.69 
 
 
438 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  34.21 
 
 
501 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  31.26 
 
 
463 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  33.02 
 
 
457 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  31.4 
 
 
457 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  32.23 
 
 
457 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  33.02 
 
 
457 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  30.77 
 
 
493 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>