More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3165 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3165  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1393  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3916  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3385  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  29.41 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0810  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.174247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0617  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02856  Transcriptional regulator  29.12 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2285  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0671  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1476  transcriptional regulator MetR, substrate-binding, LysR family protein  29.81 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5176  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55626  normal  0.248949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0305  transcriptional regulator MetR  30.38 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.879498  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3433  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0160695  normal  0.459982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4647  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.71207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02773  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5287  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0677  putative transcriptional activator METR transcription regulator protein  29.46 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0439978  normal  0.107972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0361  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353114  normal  0.67829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3080  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7372  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.732989  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2570  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4981  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0637  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.191049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1699  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1054  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03759  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3203  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03707  DNA-binding transcriptional activator, homocysteine-binding  28.35 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4052  transcriptional regulator MetR  28.35 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4151  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1309  transcriptional activator MetR  26.22 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4348  transcriptional regulator MetR  28.35 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4541  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5269  transcriptional regulator MetR  28.35 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.213002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4180  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0851648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0262  transcriptional regulator MetR  28.41 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03656  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3953  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3469  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0811329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5860  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3649  lysR-family transcriptional regulatory protein  28.41 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2185  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2782  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2261  transcriptional regulator MetR  27.97 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4357  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2039  transcriptional regulator, LysR family  26.59 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4350  transcriptional regulator MetR  28.14 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5471  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390315  normal  0.0214131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2322  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1555  transcriptional regulator MetR  28.24 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4171  transcriptional regulator MetR  28.14 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4243  transcriptional regulator MetR  28.14 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4290  transcriptional regulator MetR  28.14 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305049  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3968  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4193  transcriptional regulator MetR  28.14 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0860  transcriptional activator MetR  24.06 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2318  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0135  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0188343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0306  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0196114  decreased coverage  0.0000263412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3732  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17900  transcriptional regulator MetR  28.68 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3249  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0843  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.494273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2171  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4074  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1027  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  29.35 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2104  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3935  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  29.35 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  29.35 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  29.35 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  29.35 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2987  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  29.35 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2635  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000430494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0184  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  29.35 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13970  transcriptional regulatory protein, MetR (LysR family)  29.92 
 
 		 332 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1605  transcriptional regulator MetR  27.8 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.827323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2083  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3390  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15793  normal  0.26126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0826  transcriptional regulator, LysR family protein  25.18 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3556  LysR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0731  LysR, substrate-binding  26.07 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0767201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1631  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.132041  normal  0.262008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  25.7 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4448  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103912  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3056  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.750518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2696  transcriptional activator MetR  27 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0365  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326728  hitchhiker  0.000627592 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0158  transcriptional activator MetR  27.41 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2617  transcriptional activator MetR  27.41 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0468  transcriptional regulator MetR  27.41 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0989  transcriptional activator MetR  27.41 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2924  transcriptional activator MetR  27.41 
 
 		 353 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>