61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1338 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1338  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  38.13 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  34.97 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.82 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  37.04 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  34.07 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  33.09 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  34.78 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  35.19 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  32.71 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  30.15 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  32.14 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  29.81 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  31.37 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  31.75 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  31.75 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  26.85 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  30.08 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  31.63 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  32.95 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  29.79 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  28.87 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  35.48 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  28.16 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  26.98 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  26.92 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  30.69 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  24.81 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  29.6 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  26.4 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  29.29 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  25.56 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  28.91 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  25.26 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  27.2 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  25.76 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  25.76 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  30.59 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  29.46 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  27.07 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  29.6 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  25.77 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  26.52 
 
 		 144 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  24.62 
 
 		 140 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  26.61 
 
 		 151 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  28.41 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  24.42 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  24.42 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  26.4 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  30.21 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  26.92 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  25.3 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  28.24 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  26.02 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  26.02 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  24.74 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>