88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1471 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  800    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  43.97 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  56.38 
 
 		 290 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  54.1 
 
 		 269 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  53.95 
 
 		 260 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  55.7 
 
 		 296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  53.95 
 
 		 260 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  55.7 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  55.7 
 
 		 285 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  55.7 
 
 		 262 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  55.7 
 
 		 262 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  55.7 
 
 		 250 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  54.22 
 
 		 260 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  53.95 
 
 		 260 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  53.95 
 
 		 260 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  53.95 
 
 		 260 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  53.5 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  54.59 
 
 		 254 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  49.4 
 
 		 257 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  49 
 
 		 257 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  45.83 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  42.69 
 
 		 257 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  43.09 
 
 		 263 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  42.02 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  40.96 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  37.85 
 
 		 252 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  44.39 
 
 		 264 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  44.39 
 
 		 264 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  46.57 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  35.9 
 
 		 267 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  38.01 
 
 		 250 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  35.55 
 
 		 256 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  35.55 
 
 		 256 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  36.89 
 
 		 256 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  36.86 
 
 		 252 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  38.63 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  33.91 
 
 		 252 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  37.29 
 
 		 252 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  36.4 
 
 		 251 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  40.42 
 
 		 258 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  35.12 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  33.87 
 
 		 256 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  35.32 
 
 		 248 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  37.45 
 
 		 262 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  39.52 
 
 		 262 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  34.84 
 
 		 254 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  36.02 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  37.5 
 
 		 252 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  37.5 
 
 		 252 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  37.5 
 
 		 252 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  39.15 
 
 		 261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  37.33 
 
 		 252 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  35.86 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  35.83 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  35.83 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  34.14 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  36.52 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  34.14 
 
 		 269 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  39.74 
 
 		 159 aa  119  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4101  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03007  putative signal peptide protein  34.23 
 
 		 135 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2300  putative signal peptide protein  30.83 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0130596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2597  putative signal peptide protein  31.54 
 
 		 141 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0449231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2506  conserved hypothetical signal peptide protein  41.18 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.647607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5018  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0772233  normal  0.0946967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2112  putative signal peptide protein  40 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4980  hypothetical protein  38.82 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.855531  normal  0.53194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4037  hypothetical protein  38.82 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3002  putative signal peptide protein  38.82 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1411  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.53511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3079  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0660  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1207  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.654498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0493  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1538  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0080  hypothetical protein  39.34 
 
 		 122 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4043  hypothetical protein  32.26 
 
 		 77 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>