70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03008 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  70.42 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  70.85 
 
 		 260 aa  329  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  70.85 
 
 		 260 aa  329  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  70.85 
 
 		 260 aa  329  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  70.85 
 
 		 260 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  70.25 
 
 		 257 aa  307  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  69.83 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  67.36 
 
 		 254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  70.78 
 
 		 296 aa  294  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  70.78 
 
 		 285 aa  294  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  70.78 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  70.78 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  70.78 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  72.41 
 
 		 250 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  68.83 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  54.22 
 
 		 395 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  54.73 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  49.8 
 
 		 424 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  50.21 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  46.34 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  48.26 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  44.83 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  38.06 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  43.9 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  39.84 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  39.37 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  39.43 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  39.26 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  43.27 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  43.27 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  40.66 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  41.63 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  39.44 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  44.92 
 
 		 319 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  39.92 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  36.76 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  40.41 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  39.84 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  39.84 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  38.78 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  39.42 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  38.37 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  38.71 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  38.74 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  39.6 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  40.09 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  35.74 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  40.25 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  41.9 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  40.41 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  40.82 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  40.82 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  40.82 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  40.49 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  39.62 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  40.5 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  39.67 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  39.67 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  37.86 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  39.69 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  37.3 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  35.42 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  38.41 
 
 		 159 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>