71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4592 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  100 
 
 
252 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  100 
 
 
252 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  86.9 
 
 
252 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  86.51 
 
 
252 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  90.48 
 
 
252 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  90.48 
 
 
252 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  90.48 
 
 
252 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  82.54 
 
 
252 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  73.71 
 
 
256 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  74.21 
 
 
251 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  77.17 
 
 
254 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  66.27 
 
 
252 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  66.4 
 
 
248 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  63.45 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  62.89 
 
 
262 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  59.45 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  60.98 
 
 
262 aa  285  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  62.4 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  67.48 
 
 
258 aa  278  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  61.51 
 
 
252 aa  275  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  58.69 
 
 
269 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  59.46 
 
 
279 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  57.36 
 
 
269 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  49.4 
 
 
256 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  47.3 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  45.49 
 
 
252 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  48.07 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  48.07 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  48.07 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  48.07 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  48.07 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  48.07 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  48.07 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  47.64 
 
 
267 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  49.6 
 
 
256 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  45.49 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  48.37 
 
 
256 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  49 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  49 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  50.45 
 
 
261 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  35.81 
 
 
269 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  39.67 
 
 
260 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  37.8 
 
 
395 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  38.43 
 
 
285 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  38.43 
 
 
285 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  38.43 
 
 
296 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  37.67 
 
 
264 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  37.67 
 
 
264 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  37.09 
 
 
260 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  38.43 
 
 
262 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  38.43 
 
 
262 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  38.43 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  36.74 
 
 
424 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  36.08 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  35.19 
 
 
290 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  33.07 
 
 
254 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  35.5 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  35.5 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  35.5 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  34.19 
 
 
266 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  34.62 
 
 
257 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  34.23 
 
 
257 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  35.71 
 
 
258 aa  131  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  33.46 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  31.51 
 
 
263 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  32.38 
 
 
319 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  35.15 
 
 
252 aa  116  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  34.44 
 
 
159 aa  85.1  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  53.49 
 
 
53 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>