71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3900 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  63.56 
 
 		 260 aa  318  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  58.73 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  61.13 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  62.7 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  60.71 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  61.11 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  61.51 
 
 		 252 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  65.02 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  62.3 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  62.3 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  62.3 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  56.63 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  61.51 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  61.51 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  57.37 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  53.73 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  54.92 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  53.63 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  52.65 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  46.56 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  49.59 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  47.86 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  49.55 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  48.03 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  52.27 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  48.77 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  50.21 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  47.95 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  47.54 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  47.95 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  47.32 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  49.1 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  47.3 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  36.11 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  37.27 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  37.82 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  37.86 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  35.94 
 
 		 424 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  38.17 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  37.33 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  38.91 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  36.89 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  40.89 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  40.89 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  40.89 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  40.89 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  40.89 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  40.89 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  38.06 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  38.06 
 
 		 257 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  37.23 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  38.03 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  38.03 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  34.68 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  33.99 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  36 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  36 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  36 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  34.76 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  34.65 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  37.5 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  33.97 
 
 		 159 aa  87.4  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  53.85 
 
 		 53 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>