71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0999 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  62.16 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  68.73 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  62.4 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  57.75 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  59.6 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  58.43 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  62.12 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  64.8 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  60.08 
 
 		 251 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  60.47 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  60.31 
 
 		 252 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  57.09 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  59.92 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  60.98 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  61.48 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  62.26 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  62.26 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  62.26 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  59.45 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  59.45 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  55.06 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  48.33 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  46.67 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  45.7 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  53.16 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  45.95 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  44.58 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  46.06 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  47.92 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  47.66 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  46.85 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  46.85 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  46.85 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  46.85 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  34.13 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  38 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  38.55 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  36.44 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  39.42 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  39.42 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  39.42 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  39.42 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  39.42 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  39.42 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  35.48 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  34.82 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  35.75 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  35.75 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  35.71 
 
 		 395 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  35.54 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  35.54 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  35.54 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  33.2 
 
 		 290 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  33.6 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  33.61 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  36.08 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  32.82 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  34.66 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  35.06 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  30.92 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  34.6 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  34.25 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  42.5 
 
 		 53 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>