70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3001 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  83.85 
 
 		 260 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  82.69 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  83.08 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  78.08 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  70.85 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  67.32 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  68.2 
 
 		 296 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  67.76 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  67.76 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  68.2 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  68.2 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  69.83 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  68.83 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  51.36 
 
 		 269 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  53.95 
 
 		 395 aa  241  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  53.16 
 
 		 424 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  49.6 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  48.28 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  42.08 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  45.45 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  39.27 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  41.25 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  41.2 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  43.6 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  43.6 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  38.43 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  39.75 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  38.21 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  38.21 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  38.21 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  38.21 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  37.85 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  38.21 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  38.21 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  38.91 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  37.4 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  38.43 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  40.16 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  39.56 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  40.16 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  32.93 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  38.11 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  36.17 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  41.58 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  36.1 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  36.59 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  35.44 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  37.21 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  34.62 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  36.13 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  35.54 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  36.11 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  36.11 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  36.11 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  35.81 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  37.96 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  37.93 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  35.36 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  35.15 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  35.5 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  35.5 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  33.86 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  39.07 
 
 		 159 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  31.42 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>