40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2650 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  85.37 
 
 		 250 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  80.49 
 
 		 252 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  75 
 
 		 256 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  75 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  73.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  73.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  75 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  80 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  70.73 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  73.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  73.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  73.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  73.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  72.5 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  73.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  72.5 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  75 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  82.86 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  60 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  51.16 
 
 		 262 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  53.49 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  51.16 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  61.76 
 
 		 251 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  60.61 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  50 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  60.61 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  47.62 
 
 		 259 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  42.5 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  47.5 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  58.82 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  60 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  60 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  64.29 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  56.25 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  58.62 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  58.62 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  58.62 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  54.84 
 
 		 269 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>