71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1393 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  62.16 
 
 
260 aa  310  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  68.25 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  61.13 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  67.74 
 
 
259 aa  301  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  61.41 
 
 
248 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  63.16 
 
 
262 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  63.45 
 
 
252 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  63.05 
 
 
252 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  62.83 
 
 
269 aa  288  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  62.5 
 
 
256 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  60.64 
 
 
252 aa  278  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  61.18 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  62.78 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  60.17 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  62.65 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  62.65 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  62.65 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  62.1 
 
 
254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  60.98 
 
 
252 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  60.98 
 
 
252 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  57.37 
 
 
252 aa  241  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  49.19 
 
 
252 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  46.46 
 
 
252 aa  234  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  53.42 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  54.07 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  50.23 
 
 
250 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  51.84 
 
 
256 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  53.65 
 
 
256 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  51.44 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  51.43 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  51.43 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  51.02 
 
 
256 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  36.4 
 
 
269 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  40.25 
 
 
260 aa  158  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  38.91 
 
 
260 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  38.52 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  37.45 
 
 
395 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  38.67 
 
 
258 aa  148  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  35.08 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  41.63 
 
 
285 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  41.63 
 
 
262 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  41.63 
 
 
296 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  41.63 
 
 
262 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  41.63 
 
 
285 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  41.63 
 
 
250 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  39.41 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  37.24 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  37.5 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  37.5 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  35.54 
 
 
424 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  35 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  38.71 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  38.71 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  37.34 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  37.34 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  34.73 
 
 
319 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  35.9 
 
 
300 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  32.81 
 
 
263 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  35.15 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  30.07 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  48.78 
 
 
53 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>