71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0092 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  99.6 
 
 
252 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  63.56 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  68.42 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  67.21 
 
 
252 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  65.59 
 
 
251 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  68.42 
 
 
252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  68.83 
 
 
252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  68.83 
 
 
252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  68.83 
 
 
252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  62.1 
 
 
260 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  63.31 
 
 
254 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  57.83 
 
 
262 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  66.4 
 
 
252 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  66.4 
 
 
252 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  59.6 
 
 
260 aa  292  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  60.66 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  59.75 
 
 
259 aa  277  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  58.87 
 
 
252 aa  274  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  60.82 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  58.82 
 
 
269 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  57.92 
 
 
269 aa  263  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  53.11 
 
 
279 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  50.65 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  50.65 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  50.65 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  50.65 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  50.65 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  50.22 
 
 
260 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  49.78 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  49.78 
 
 
267 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  43.8 
 
 
252 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  48.95 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  47.62 
 
 
256 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  46.01 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  48.12 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  48.48 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  42.15 
 
 
252 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  47.83 
 
 
256 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  47.83 
 
 
256 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  47.69 
 
 
261 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  37.86 
 
 
269 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  37.18 
 
 
260 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  38.37 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  35.32 
 
 
395 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  39.34 
 
 
264 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  39.15 
 
 
290 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  39.34 
 
 
264 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  35.47 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  35.86 
 
 
424 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  36.36 
 
 
257 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  37.02 
 
 
266 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  36.25 
 
 
319 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  35.04 
 
 
260 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  37.93 
 
 
285 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  35.04 
 
 
260 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  35.04 
 
 
260 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  37.93 
 
 
296 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  37.93 
 
 
262 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  37.93 
 
 
262 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  35.59 
 
 
257 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  37.93 
 
 
285 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  37.93 
 
 
250 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  35.59 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  34.02 
 
 
254 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  37.08 
 
 
300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  34.73 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  32.23 
 
 
263 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  37.93 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  36 
 
 
159 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>