19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2112 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2112  putative signal peptide protein  100 
 
 		 150 aa  297  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2506  conserved hypothetical signal peptide protein  98.67 
 
 		 150 aa  293  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.647607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2300  putative signal peptide protein  63.09 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0130596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3002  putative signal peptide protein  63.76 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4037  hypothetical protein  63.76 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4980  hypothetical protein  63.76 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.855531  normal  0.53194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2597  putative signal peptide protein  56.64 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0449231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5018  hypothetical protein  53.79 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0772233  normal  0.0946967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4101  hypothetical protein  65.62 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1411  hypothetical protein  66.67 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.53511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1538  hypothetical protein  66.67 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1207  hypothetical protein  66.67 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.654498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0493  hypothetical protein  66.67 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0660  hypothetical protein  66.67 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3079  hypothetical protein  66.67 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03007  putative signal peptide protein  57.63 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4043  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  40.4 
 
 		 424 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  40 
 
 		 395 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>