19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4043 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4043  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3079  hypothetical protein  71.43 
 
 
136 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0493  hypothetical protein  71.43 
 
 
136 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0660  hypothetical protein  71.43 
 
 
136 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1207  hypothetical protein  71.43 
 
 
136 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.654498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1538  hypothetical protein  70 
 
 
136 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1411  hypothetical protein  70 
 
 
136 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.53511  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03007  putative signal peptide protein  60.87 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2300  putative signal peptide protein  60.29 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0130596  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5018  hypothetical protein  59.42 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0772233  normal  0.0946967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2506  conserved hypothetical signal peptide protein  56.34 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.647607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2112  putative signal peptide protein  55.56 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4101  hypothetical protein  59.7 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3002  putative signal peptide protein  52.24 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4037  hypothetical protein  52.24 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4980  hypothetical protein  52.24 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.855531  normal  0.53194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2597  putative signal peptide protein  55.38 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0449231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  51.67 
 
 
424 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  32.26 
 
 
395 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>