165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0955 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0955  methyltransferase-like protein  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  54.4 
 
 
278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  51.38 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2294  hypothetical protein  53.54 
 
 
287 aa  206  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0248697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  53.89 
 
 
275 aa  204  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  43.65 
 
 
297 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  36.57 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2036  hypothetical protein  37.25 
 
 
282 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1957  hypothetical protein  37.25 
 
 
282 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04179  hypothetical protein  36.32 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0392  hypothetical protein  35.11 
 
 
280 aa  95.5  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37177  predicted protein  35.05 
 
 
239 aa  95.1  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0215141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  40.22 
 
 
522 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1671  O-methyltransferase family protein  29.41 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1705  O-methyltransferase family protein  29.41 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.301105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  33.91 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  31.9 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  31.9 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  28.7 
 
 
400 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  31.9 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  24.21 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  39.56 
 
 
515 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  26.25 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  33.33 
 
 
523 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  31.03 
 
 
425 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
425 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  32.19 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  31.03 
 
 
423 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  25.16 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  31.03 
 
 
425 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  31.03 
 
 
425 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  31.03 
 
 
425 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  31.03 
 
 
425 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  25.16 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  31.03 
 
 
404 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
404 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  34.43 
 
 
520 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  31.03 
 
 
404 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  34.43 
 
 
520 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  27.64 
 
 
389 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  31.03 
 
 
422 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  34.43 
 
 
520 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  31.9 
 
 
404 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  31.45 
 
 
400 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  25.94 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  25.94 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  25.94 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  31.51 
 
 
285 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  28.42 
 
 
283 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  29.31 
 
 
400 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  33.91 
 
 
409 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  29.31 
 
 
397 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  26.17 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  26.96 
 
 
403 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  28.45 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  26.96 
 
 
403 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  30.99 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  35.96 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  26.96 
 
 
400 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  26.96 
 
 
403 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  26.39 
 
 
389 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  35.29 
 
 
439 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  27.83 
 
 
397 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  27.22 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  26.09 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  26.96 
 
 
403 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  26.96 
 
 
403 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  28.03 
 
 
290 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  26.09 
 
 
396 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  26.09 
 
 
396 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  27.81 
 
 
389 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  40.51 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  27.81 
 
 
389 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  30.14 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  29.17 
 
 
364 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  34.21 
 
 
402 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  40.51 
 
 
179 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  40.51 
 
 
179 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  24.53 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  31.82 
 
 
519 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  26.09 
 
 
367 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  26.09 
 
 
391 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  27.83 
 
 
398 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.57 
 
 
202 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  26.09 
 
 
367 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  27.83 
 
 
397 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  23.9 
 
 
291 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  28.57 
 
 
285 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1572  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.83 
 
 
444 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  31.21 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  28.46 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  31.68 
 
 
389 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>