13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0392 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0392  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04179  hypothetical protein  74.37 
 
 
281 aa  431  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1957  hypothetical protein  66.31 
 
 
282 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2036  hypothetical protein  65.95 
 
 
282 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  41.15 
 
 
297 aa  133  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  33.58 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0955  methyltransferase-like protein  35.11 
 
 
249 aa  95.5  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2294  hypothetical protein  33.97 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0248697 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37177  predicted protein  34.3 
 
 
239 aa  92  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0215141  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  30.24 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  29.01 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>