54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37177 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_37177  predicted protein  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0215141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  41.85 
 
 
293 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  39.79 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  34.39 
 
 
278 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2294  hypothetical protein  33.51 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0248697 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0955  methyltransferase-like protein  34.69 
 
 
249 aa  95.1  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  32.63 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  35.03 
 
 
275 aa  92.4  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0392  hypothetical protein  34.3 
 
 
280 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1957  hypothetical protein  32.98 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04179  hypothetical protein  35.26 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2036  hypothetical protein  32.45 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  35.25 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  34.43 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  33.61 
 
 
295 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  29.51 
 
 
290 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  32.79 
 
 
285 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  32.59 
 
 
499 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  33.63 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  27.03 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  27.41 
 
 
1040 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  31.34 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  31.91 
 
 
528 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  32.17 
 
 
567 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  32.29 
 
 
285 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  34.04 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  29.45 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  29.45 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  29.45 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  29.45 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  29.45 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  29.45 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  26.53 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  27.52 
 
 
381 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  29.36 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  33.33 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  34.69 
 
 
286 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  28.83 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.8 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  25.74 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  33.33 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  33.33 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.2 
 
 
407 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  29.03 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  31.3 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  40.32 
 
 
287 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  28.78 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  31.73 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1498  O-methyltransferase family protein  28.47 
 
 
212 aa  42.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  34.58 
 
 
536 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  26.95 
 
 
334 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  25.64 
 
 
305 aa  42  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.41 
 
 
282 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 
268 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>