13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2036 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2036  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1957  hypothetical protein  98.94 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0392  hypothetical protein  65.95 
 
 
280 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04179  hypothetical protein  64.26 
 
 
281 aa  374  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  31.41 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0955  methyltransferase-like protein  37.25 
 
 
249 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2294  hypothetical protein  33.21 
 
 
287 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0248697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  30.15 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  35.35 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  34.74 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37177  predicted protein  32.45 
 
 
239 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0215141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>